Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mesp2O08574 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms