Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
U90926O08546 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
U90926O08546 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
U90926O08546 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
U90926O08546 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
U90926O08546 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
U90926O08546 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
U90926O08546 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
U90926O08546 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms