Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21900J3QP38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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