Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21797J3QNW5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21797J3QNW5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21797J3QNW5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms