Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp616J3QN14 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms