Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E030018B13RikJ3QMS9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E030018B13RikJ3QMS9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms