Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21820J3KMU2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21820J3KMU2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21820J3KMU2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms