Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r34G3XA52 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r34G3XA52 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms