Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r167G3UW71 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms