Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h7bF8VPP8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h7bF8VPP8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms