Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm8220F6YKI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm8220F6YKI2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms