Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21970F6XX07 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21970F6XX07 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms