Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptbn5F6UCX4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptbn5F6UCX4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms