Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngap1F6SEU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngap1F6SEU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms