Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm340F6RGI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms