Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms