Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Urb2E9Q7L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Urb2E9Q7L1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Urb2E9Q7L1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Urb2E9Q7L1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms