Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Simc1E9Q6E9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Simc1E9Q6E9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms