Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms