Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc1E9Q5K9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ythdc1E9Q5K9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdc1E9Q5K9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms