Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb9E9Q5G2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb9E9Q5G2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms