Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20518E9Q548 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms