Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip11E9Q512 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip11E9Q512 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms