Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tarbp1E9Q368 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tarbp1E9Q368 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tarbp1E9Q368 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms