Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc4E9Q236 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc4E9Q236 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc4E9Q236 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms