Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms