Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc171E9Q1U1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc171E9Q1U1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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