Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt78E9Q0F0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt78E9Q0F0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms