Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm9972E9Q053 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9972E9Q053 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms