Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fndc1E9Q043 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fndc1E9Q043 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fndc1E9Q043 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms