Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf11E9PZM7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf11E9PZM7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scaf11E9PZM7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf11E9PZM7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms