Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5415E9PXF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms