Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rsf1E9PWW9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rsf1E9PWW9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rsf1E9PWW9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms