Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim30dE9PWL0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30dE9PWL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms