Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Clca3bE9PUL3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca3bE9PUL3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms