Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Piezo1E2JF22 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Piezo1E2JF22 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms