Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms