Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3676D3Z236 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3676D3Z236 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms