Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1H5

Cd209f, CD209f antigen, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209fD3Z1H5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd209fD3Z1H5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd209fD3Z1H5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms