Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
3425401B19RikD3Z1D3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
3425401B19RikD3Z1D3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms