Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms