Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

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Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf1D3YY23 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lonrf1D3YY23 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf1D3YY23 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf1D3YY23 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf1D3YY23 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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