Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms