Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC048679D3YXE9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC048679D3YXE9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms