Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rexo5D3YW29 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo5D3YW29 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms