Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17333C6EQI3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm17333C6EQI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm17333C6EQI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm17333C6EQI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm17333C6EQI3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17333C6EQI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm17333C6EQI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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