Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms