Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc11B2RXC1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc11B2RXC1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms