Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cspp1B2RX88 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cspp1B2RX88 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cspp1B2RX88 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms