Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clrn2B2RVW2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clrn2B2RVW2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms